Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab33bO35963 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab33bO35963 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab33bO35963 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms