Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc1O35704 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc1O35704 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc1O35704 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms