Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih1O35372 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Cnih1O35372 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cnih1O35372 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cnih1O35372 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cnih1O35372 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih1O35372 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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