Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r89O35199 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r89O35199 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms