Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArxO35085 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArxO35085 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArxO35085 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArxO35085 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArxO35085 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArxO35085 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArxO35085 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArxO35085 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ArxO35085 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ArxO35085 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArxO35085 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArxO35085 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArxO35085 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArxO35085 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArxO35085 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ArxO35085 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArxO35085 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArxO35085 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArxO35085 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArxO35085 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArxO35085 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArxO35085 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArxO35085 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArxO35085 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArxO35085 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArxO35085 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArxO35085 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArxO35085 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArxO35085 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArxO35085 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArxO35085 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArxO35085 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArxO35085 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms