Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snap23O09044 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap23O09044 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap23O09044 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap23O09044 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap23O09044 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap23O09044 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms