Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8050L7N2E3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8050L7N2E3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms