Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6871L7N248 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6871L7N248 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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