Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms