Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21411J3KMS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21411J3KMS0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms