Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zkscan2G3X952 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zkscan2G3X952 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms