Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NpcdF8VQB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NpcdF8VQB8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms