Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh11xF6ZNL5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms