Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms