Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Simc1E9Q6E9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Simc1E9Q6E9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms