Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17727E9Q4V7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17727E9Q4V7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm17727E9Q4V7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm17727E9Q4V7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17727E9Q4V7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17727E9Q4V7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17727E9Q4V7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17727E9Q4V7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17727E9Q4V7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm17727E9Q4V7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17727E9Q4V7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17727E9Q4V7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms