Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ApobE9Q414 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ApobE9Q414 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ApobE9Q414 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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