Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc171E9Q1U1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc171E9Q1U1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc171E9Q1U1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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