Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx60E9PZQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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