Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1110002E22RikE0CYV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1110002E22RikE0CYV9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms