Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm5930D3Z257 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5930D3Z257 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5930D3Z257 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms