Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skint2A7XUX6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms