Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2c2A7L9Z8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2c2A7L9Z8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms