Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp4A4UUI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp4A4UUI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp4A4UUI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp4A4UUI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms