Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb1A2AQ07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb1A2AQ07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms