Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms