Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbf1A2A870 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbf1A2A870 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbf1A2A870 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms