Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms