Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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