Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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