Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Cited1P97769 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms