Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lsm6P62313 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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