Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
P18530 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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P18530 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
P18530 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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