Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18524 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18524 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms