Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr1221-203ENSMUST00000213404 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Optn-201ENSMUST00000027986 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Trim66-201ENSMUST00000033339 4354 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Agtr1b-201ENSMUST00000068316 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp446-203ENSMUST00000108536 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nefm-201ENSMUST00000022638 3334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Fam50a-201ENSMUST00000114160 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms