Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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