Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Atp8b5A3FIN4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Atp8b5A3FIN4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Atp8b5A3FIN4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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