Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Derl3Q9D8K3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms