Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.5 ms