Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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