Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms