Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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NfiaQ02780 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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