Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms