Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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