Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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