Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms