Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms