Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mrpl39Q9JKF7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms