Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem53Q9D0Z3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms