Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ufsp2Q99K23 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms